V průběhu historie Národního registru pramenů a studánek vzniklo několik mobilních aplikací, které vyvíjeli nezávislí autoři. Tyto aplikace již nejsou dostupné. Od října 2026 je k dispozici nová oficiální aplikace registru pro platformu Android, jejímž autorem je Hynek Uhlíř.
Aplikace eStudanky slouží k zobrazování mapy vodních zdrojů a k usnadnění práce s jejich údaji přímo v terénu. Pro zobrazení aktuální polohy na mapě aplikace využívá polohu zařízení, přičemž historii Vašeho pohybu neukládá. V nynější verzi je možné vedle zobrazení informací o zdrojích, odeslat opravu a doplnění informací k jakémukoliv záznamu. Aplikace neobsahuje reklamní ani analytické nástroje. Aplikace vyžaduje udělení oprávnění k poloze, fotoaparátu nebo fotografiím. Jeho udělení je plně na uživateli a je dobrovolné, ovšem jeho odmítnutí může omezit některé funkce aplikace.